A master thesis from Aalborg University
Prædiktion af Individers Afstamning ved Anvendelse af Ancestry Informative Markers
[Predicting the Ancestry of Individuals using Ancestry Informative Markers]
Forfatter(e)
Semester
4. semester
Uddannelse
Udgivelsesår
2019
Afleveret
2019-06-03
Antal sider
63 pages
Abstract
I dette speciale undersøges individers afstamning ved brug af Ancestry Informative Markers (AIMs). Der opstilles et hypotesetest, som vurderer, om en specifik profil stammer fra en given population. I analysen er der brugt klassifikationstræer, random forest og lasso-regression til at udvælge en delmængde af markørerne, som bedst skelner mellem populationerne. Derudover er der undersøgt markørernes sensitivitet samt markørernes coverage og tilbøjelighed til at give et dropout. Analysen viste, at klassifikationstræer med en filtrering for de mindst sigende markører er de bedste modeller. Det førte til to modeller, CART20 og CART50, som har henholdsvis 21 og 7 markører. Med hensyn til markørernes sensitivitet er rs671, rs3811801, rs1800414, rs4821004, rs2125345 og rs2899826 de mest sensitive, og i forhold til markørernes dropout er rs1296819, rs12439433 og rs4833103 de mest tilbøjelige til at give et dropout.
Emneord
Retsgenetik ; AIMs ; SNP ; Individers afstamning ; Statistik
Kolofon: Denne side er en del af AAU Studenterprojekter — Aalborg Universitets studenterprojektportal. Her kan du finde og downloade offentligt tilgængelige kandidatspecialer og masterprojekter fra hele universitetet fra 2008 og frem. Studenterprojekter fra før 2008 kan findes i trykt form på Aalborg Universitetsbibliotek.
Har du spørgsmål til AAU Studenterprojekter eller Aalborg Universitets forskningsregistrering, formidling og analyse, er du altid velkommen til at kontakte VBN-teamet. Du kan også læse mere i AAU Studenterprojekter FAQ.