En prototype på en SNOMED CT designet skabelon til samtidig registrering af forsøgsdata til journalnotat og forsøgsprotokol med henblik på anvendelse til dataudtræk
Oversat titel
A prototype on a SNOMED CT designed template to one-time collection of research data for electronic health record and clinical protocol to extract data
Forfatter
Sathananthan, Sathesh
Semester
4. semester
Uddannelse
Udgivelsesår
2016
Afleveret
2016-12-20
Antal sider
169
Abstract
Når kliniske forsøgsprotokoller er adskilt fra patientjournalen, bliver det svært for læger at indsamle ensartede og valide data. SNOMED CT (SCT), en standardiseret klinisk terminologi, kan skabe forbindelse til journalen og støtte sikre dataudtræk. Men der mangler viden om, hvordan SCT’s teoretiske potentiale omsættes til praksis. Dette speciale undersøger, hvilke udfordringer der opstår, når man designer en løsning, der bruger referencemodellen SNOMED CT til at koble de to dokumenttyper—journal og den adskilte protokol—for at øge datavaliditeten i kliniske forsøgsprotokoller. Først analyseres en eksisterende protokol. Dernæst kvalificeres et design med afsæt i viden om SCT og dataudtræk. Til sidst verificerer protokollens ejer en skabelon via tænke-højt-test og interview. Litteraturstudier indgår i vidensgrundlaget. Der blev udviklet en prototype på en SCT-baseret skabelon. Det var udfordrende at koble eksisterende klassifikationsskalaer til SCT. Skabelonen dækkede 98,8 % af protokollens indhold, men kun 69 ud af 81 elementer kunne mappes med prækoordinerede begreber (enkeltkoder i SCT). En central udfordring er at bevare bagudkompatibilitet, hvis klassifikationsskalaer skal erstattes af en ren SCT-løsning. Specialet bidrager med ny viden om, hvordan SCT kan bruges til at styrke validiteten af dataudtræk til forsøgsprotokoller. Valideringen er ikke nødvendigvis repræsentativ, da den er gennemført retrospektivt, men den peger på, at de valgte begreber skal give mening i den kontekst, de bruges i.
When clinical trial protocols are separate from the patient record, it becomes difficult for doctors to collect consistent, valid data. SNOMED CT (SCT), a standardized clinical terminology, can link protocols to medical records and support reliable data extraction. However, practical methods for realizing SCT’s theoretical potential are lacking. This thesis examines the challenges of designing a solution that uses the SNOMED CT reference model to connect the two document types—the medical record and the detached protocol—to improve data validity in clinical trial protocols. First, an existing protocol was analyzed. Next, a design was developed and refined using knowledge about SCT and data extraction. Finally, the template was verified by the protocol owner through think-aloud testing and an interview. Literature studies informed the work. A prototype SCT-based template was created. Linking existing classification scales to SCT proved difficult. The template achieved 98.8% coverage, but only 69 of 81 items could be mapped with pre-coordinated concepts (single SCT codes). A key challenge is preserving backward compatibility if classification scales are replaced by a purely SCT-based design. The thesis contributes new insights into using SCT to strengthen the validity of data extracted for trial protocols. The validation results are not necessarily representative because they were gathered retrospectively, yet they underscore that selected concepts must be meaningful in their intended context.
[Dette resumé er genereret ved hjælp af AI]
Emneord
Terminologi ; Klassifikation ; SNOMED CT ; Klassifikationssystemer ; begrebssystemer ; terminology ; classifikation ; forsøgprotokol ; journal ; elektronisk patientjournal ; protokol ; dataudtræk ; klinisk forsøg ; validitet ; interoperabilitet ; semantisk interoperabilitet ; integration ; referencemodel ; generisk