Ændring af elges (Alces alces) mikrobiom efter en translokation fra Sverige til Lille Vildmose i Danmark

Modification af moose (Alces alces) microbiome after af translocation from Sweden to Lille Vildmose in Denmark

Larsen, Mark Holm

4. semester

Biologi, Kandidat

2017

2017-01-10

50

Dette speciale undersøger, hvordan tarmmikrobiomet hos fem elge påvirkes af en translokation fra to svenske indhegninger (Målilla og Vrigstad) til Lille Vildmose i Danmark som led i et naturgenopretningsprojekt. Mikrobiomet blev kortlagt ved 16S rRNA amplicon-sekventering af bakteriesamfund i fæcesprøver. Der blev indsamlet prøver ved ankomsten til Danmark, otte måneder senere i forbindelse med bedøvelse, samt i felten ét år efter ankomsten; derudover indgik referenceprøver fra elge i de svenske indhegninger ét år efter translokationen. Alle fem elge udviste ændringer i deres mikrobiom efter både otte måneder og ét år. Efter de første otte måneder sås en højere diversitet, men denne stigning genfandtes ikke i de feltindsamlede étårs-prøver, hvilket sandsynligvis afspejler forskelle i prøvehåndtering, da længere tids eksponering i felten kan fremme aerobe bakterier og ændre fæcesprøver. Derfor anbefales det at afklare, hvor længe elgefæces kan ligge i felten før indsamling i fremtidige studier. Analysen af kernebakterier viste desuden, at elgene fra Vrigstad havde flere kernebakterier ved ankomst og bevarede en større andel heraf efter otte måneder sammenlignet med elgene fra Målilla. Samlet peger resultaterne på, at translokation og nye omgivelser kan omforme elges tarmmikrobiom, og at standardiseret prøvetagning er afgørende for at tolke ændringer over tid.

This thesis examines how the gut microbiome of five moose is affected by translocation from two Swedish enclosures (Målilla and Vrigstad) to Lille Vildmose in Denmark as part of a habitat restoration project. The microbiome was profiled using 16S rRNA amplicon sequencing of bacterial communities in fecal samples. Samples were collected upon arrival in Denmark, again eight months later during sedation, and in the field one year after arrival; additional reference samples from moose in the Swedish enclosures were obtained one year after the translocation. All five moose showed shifts in their microbiome after both eight months and one year. Microbial diversity increased at eight months, but this increase was not evident in the field-collected one-year samples, likely reflecting differences in sampling and handling because prolonged exposure in the field can favor aerobic bacteria and alter fecal microbiota. Accordingly, future work should establish how long moose feces can lie in the field before collection. Core-microbiota analyses further indicated that moose from Vrigstad had more core bacteria at arrival and retained a larger fraction after eight months than those from Målilla. Overall, the findings suggest that translocation and new environmental conditions can reshape moose gut microbiota, and that standardized sampling is critical for interpreting temporal changes.

[Dette resumé er genereret med hjælp fra AI direkte fra projektet (PDF)]

Download
Vis denne rapport i AAU Studenterprojekter