En prototype på en SNOMED CT designet skabelon til samtidig registrering af forsøgsdata til journalnotat og forsøgsprotokol med henblik på anvendelse til dataudtræk

Abstract

Lægerne har et vidensproblem i forhold til at få opsamlet valid data i fællesskab til kliniske forsøgsprotokoller da denne er løsrevet fra journalen. SNOMED CT (SCT) er velegnet til at koble op mod journalen med henblik på dataudtræk. Dog mangler der viden om hvordan metoderne for realisering af de teoretiske potentialer ved SCT anvendes. Derfor undersøges hvilke udfordringer er der relateret til udvikling af et design med anvendelse af referencemodellen SNOMED CT til at koble de to dokumenttyper journal og den løsrevet protokol med henblik på at skabe validitet i dataudtræk i kliniske forsøgsprotokoller? Først foretages en analyse af en eksisterende protokol, herefter sker en kvalificering af design ved at koble det med viden om SCT i forhold til dataudtræk, og sidst sker en verificering af designet af skabelonen af protokollens ejer ved tænke-højt-test og interview. Vidensindsamling er bl.a. foretaget ved litteraturstudier. En prototype på en SCT skabelon blev designet og der var udfordringer i at koble klassifikationsskalaer sammen med SCT. Dækningsgraden af skabelonen er 98,8 %, men det var kun muligt at mappe 69 ud 81 med prækoordinerede begreber. Udfordringen ligger i at bevare bagudkompatibilitet hvis en protokol skal designes udelukkende på SCT som erstatning for klassifikationsskalaerne. Speciale bidrager med ny viden til at skabe validitet i den data der trækkes ud til anvendelse i forsøgsprotokoller ved anvendelse af SCT. Resultaterne fra validering af skabelonen er umiddelbart ikke repræsentative da disse er opsamlet retrospektivt, men omvendt har det værdi i forhold til at forstå at de begreber som udvælges skal være meningsfuldt i relation til den kontekst de skal anvendes i.

Some doctors have a knowledge problem in proportion to collect valid data in unison to clinical research protocols wich is detached from the health record. The international terminology model SNOMED CT (SCT) is suitable to connect to the health record to data extraction. Though knowledge is missing on methods to implement the teoretical potentials about SCT in a research protocol can be used. On this basis the challenges related to development of a design with the usage of SCT to connect two types of document health record and the detached protocol regarding creating a valid data extraction in clinical trials are studied. This is studied by first making an analysis of a existing protocol whereafter a qualification of design by connecting it to the knowlegde about SCT related to the data extraction. Finally a verification of the template design takes place by the protocol owner through a combination of think aloud test and interview. The knowledge collection is amongst other done through literaturestudies. A prototype on a SCT template is designed and the were some challenges in order to connect the classification systems wit SCT. The coverage of the template is 98,8 % but it was only possible to map 69 out of 81 with precoordinated concepts. The challenge lies in keeping backward compatibility if a protocol is designed entirely on SCT as a replacement for the classification systems. This study contributes with new knowledge to create validity in the data which is extracted to clinical trials by using SCT. Results validation of the templates is at first not represenative because they are collected retrospective during the think aloud test but on the other hand it does not have any vallue in order to understanding the concepts which are chosen to be meaningful i relation to the context they are used in.

A master thesis from Aalborg University

En prototype på en SNOMED CT designet skabelon til samtidig registrering af forsøgsdata til journalnotat og forsøgsprotokol med henblik på anvendelse til dataudtræk

[A prototype on a SNOMED CT designed template to one-time collection of research data for electronic health record and clinical protocol to extract data]